本病各期均应注意与结核相鉴别，主要依靠培养及相应的血清学检查，原发性组织胞浆菌病的急性期应与病毒，细菌性及其他真菌性肺部炎症以及弥漫性肺部纤维化，类脂质性肺部病变等相鉴别，急性播散性组织胞浆菌病有脾肿大，淋巴结病变，贫血 及白细胞减少时，应与内脏利什曼病 ，淋巴瘤 ，传染性单核细胞增多 症，马内菲青霉病 ，痢疾，布鲁菌病 等鉴别，皮肤及黏膜损害，应与肿瘤，孢子丝菌病 ，梅毒 ，细菌性蜂窝织炎 ，皮肤结核，弓形虫病 或其他系统性真菌感染等相鉴别。
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