急性病毒性心肌炎医学上称之为病毒性心肌炎，是痢疾最危险的并发症之一。部分痢疾可由病毒引起，最常引起心肌炎的病毒是一种称为柯萨奇病毒的肠道病毒，它可直接进入心肌细胞造成损害，也可使机体产生某些有害物质使心肌细胞受损，导致心肌变性，还会累及心包、心内膜，若侵犯心脏起搏系统，则将危及生命。
心脑血管意外这是造成老年人急性痢疾致死的不容忽视的并发症。腹泻时体内大量水分和钠、钾、钙、镁等阳离子从大便中排出，水分丧失使人体处于脱水状态，血容量减少，血液粘稠度增加，血流缓慢，容易形成血栓并阻塞血管，使冠状动脉阻塞造成心绞痛和心肌梗塞，脑血管阻塞引起缺血性中风。钠、钾、钙、镁是体内重要的阳离子，除维持血液酸碱平衡外，对维持神经传导功能和心跳节律具有举足轻重的作用，缺乏时可造成严重心律紊乱和猝死。
脱水和酸中毒是急性痢疾的主要致命原因，平时身体内代谢产生的二氧化碳通过呼吸排出，其余的废物需要经过水的运送通过肾脏由尿排出体外。脱水时尿量因机体内水分损失而减少，严重时甚至无尿，这就会使体内代谢产生的废物排出减少而在体内蓄积，使机体发生中毒症状，其临床表现除呼吸改变外，还可出现疲乏无力及神经系统症状等。
胃病复发痢疾后人体的消化功能逐渐下降，肠道抗病能力也减弱，使胃肠功能的负担加重，常会导致胃病的复发。
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