由于棘阿米巴性巩膜炎少见,常误诊,即使首先考虑巩膜棘阿米巴感染,诊断仍很难证实,详细询问病史,裂隙灯检查,对涂片或活检组织进行特殊染色和用大肠杆菌性无养分培养基培养,可以早期诊断,常规角膜上皮涂片找不到棘阿米巴或棘阿米巴培养阴性,因为棘阿米巴仅存在于角膜基质内。
主要与单孢病毒性巩膜炎相鉴别,眼剧痛与体征不一致,抗病毒治疗无效,组织培养和活检有棘阿米巴原虫为其诊断鉴别要点。
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